不孕症可以是男方或女方單方面的問題，也可以是雙方都有問題。女性因素約佔40%，男性因素也可高達40%，而雙方都有問題的佔20%。少部份找不到病因的稱為不明原因性不孕。

女性因素

1. 排卵問題：
   排卵是一個相當複雜的內分泌過程，所牽涉到的內分泌器官包下視丘 (hypothalamus)，腦下垂體 (pituitary gland) 及卵巢 (ovary)。而下視丘又受到來自於腦部其他訊息的影響。臨床常見造成排卵問題有下列情況： a、多囊性卵巢症 b、泌乳激素過高 c、男性激素過高 d、生活狀態重大的變革或承受太大的身心壓力 e、體重過胖或太瘦 f、甲狀腺疾病 g、年齡越高卵巢排卵功能及卵子品質越差。

2. 子宮頸因素：
   子宮頸的腺體在排卵期會分泌大量似蛋清狀的分泌物以利精虫通過，並且讓精虫可以存活較長時間。下列原因可能影響子宮頸功能： a、排卵期子宮頸分泌物不足或太黏稠 b、子宮頸狹窄 c、子宮頸發炎 d、子宮頸曾經接受錐形切片、電燒、雷射等手術 e、子宮頸分泌物含精虫抗體。

3. 骨盆腔及輸卵管因素：
   下列原因可能會造成輸卵管的沾粘不通或扭曲變形： a、腹腔手術或骨盆腔發炎病史 b、子宮內膜異位症 c、輸卵管發炎 d、子宮肌瘤壓迫。

4. 子宮因素：
   子宮內膜是胚胎著床的地方，缺乏良好的內膜（子宮內膜太薄或子宮腔沾粘）將使好不容易受精的胚胎無法著床懷孕。另外子宮內膜瘜肉、子宮中隔、黏膜下肌瘤及其他先天性子宮畸形都可能是不孕的原因。

男性因素

1. 精子減少 (Oligospermia): 精子濃度少於 20 x 106 /ml
2. 精子活動力異常(Asthenospermia): 直線進行的精子少於50%(Grade 2 and 3) or Grade 3 < 25%
3. 畸形精子(Teratospermia): 正常形態之精子< 30%
4. 精子減少，活動力差併畸形症候 (Oligoasthenoteratospermia, OTA syndrome)
5. 無精子症(Azoospermia): 精液中完全沒有精子
6. 無精液症(Aspermia): 沒有射精或完全沒有精子