醫學研究科

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     Laboratory of Cancer Genomics

蔡國旺  博士  助理研究員                                                  

Kuo-Wang Tsai Ph. D.

研究專長

1.   Bioinformatics

2.   RNA Processing

3.   Epigenetic Regulation 

4. MicroRNA Regulation

聯絡資料

地址：81362高雄市左營區大中一路386號, 教研部4F

電話：(07) 342-2121 ext. 1510

傳真：(07) 346-8506

學歷      

博士  國防醫學院 生命科學研究所 (2003/06-2007/11)

碩士  國立陽明大學 醫學生物技術所 (2001/6-2003/06)

學術經歷

助理研究員  高雄榮民總醫院 教學研究部 (2011~)

博士後研究員  中央研究院 生物醫學科學研究所 (2008~2010)

研究助理   臺大醫院 病理部 (2000/06-2001/06)

獲獎與榮譽

2007：第七屆國防醫學院研究生論文研討會 第一名

2007:   第五屆財團法人台北市林榮耀教授學術教育基金會 優秀論文獎 第二名

2008：第三屆永信李天德醫藥科技獎 傑出論文獎

目前研究方向

    1.   Epigenetic Regulation

研究顯示在癌症發生過程中，整個基因體中的甲基化區域分布會發生很明顯的改變，而這些改變可能會造成抑癌基因(tumor suppressor)或是致癌基因(oncogenes)的異常表現，基於此理論基礎我們利用去甲基化藥劑5-Aza-dC處理胃癌細胞株，目前已經找到50個相關的miRNA以及10個磷酸激酶，這些研究成果，將來可以提供作為往後的實驗方向。

2.   MicroRNA Regulation

近幾年發現細胞內大量存在小片段RNA，稱之為微型核糖核酸(microRNA)，microRNA長度只有21-25個核苷酸(nucleotide)，而這些microRNA被產生後送往細胞質干擾基因表現，藉由與mRNA鍵結成雙股再將其分解消滅，目前已知道miRNA在發育過程以及各種疾病都扮演著重要的角色，而miRNA跟一般基因不同，miRNA靠調控其標的基因來執行功能，近幾年來研究發現miRNA與很多疾病息息相關，因此目前也積極運用生物資訊方式預測可能性較高的標的基因，最後再結合傳統實驗進一步確認。

3.   Aging

截至目前為止台灣地區洗腎人口高居全球第一，然而臨床數據顯示洗腎病人很高比例會因心血管老化而導致死亡，目前為止其相關機制並不清楚，因此目前正與台北榮總腎臟科林堯彬醫師合作研究腎臟功能不全引發心血管老化機制，利用大鼠腎功能不全的模式我們成功的找到43個可能引發心血管老化的microRNA candidates，目前也正鎖定5個micoRNAs正在深入研究，除此之外我們對於洗腎病患因長年腹膜透析而導致其腹膜老化纖維化也非常感興趣，目前我們已分析腹膜透析液中的microRNA，希望能找到一些引發腹膜透析老化纖維化相關的microRNA，以期將來可以當作治療的candidates或是當作腹膜纖維化的marker。

期刊論文  

Articles:

1. K.W. Tsai, W.C. Lin, Quantitative analysis of wobble splicing indicates that it is not tissue specific, Genomics 88 (2006) 855-864.

2. K.W. Tsai, W.Y. Tarn, W.C. Lin, Wobble splicing reveals the role of the branch point sequence-to-NAGNAG region in 3' tandem splice site selection, Mol Cell Biol. 27 (2007) 5835-5848.

3. K.W. Tsai, H. C. Tseng, W.C. Lin, Two wobble splicing events affect ING4 protein

     subnuclear localization and degradation. Exp. Cell Res. 314 (2008) 3130-3141. 

4. 蔡國旺 林文昌, 人類基因跳動式剪接機制, 生物醫學雜誌, 第一卷第三期 (2008) 249-257.

5. K.W. Tsai, H.W. Kao, H.C. Chen, S.J. Chen, and W.C. Lin, Epigenetic control of the expression of a primate-specific microRNA cluster in human cancer cells. Epigenetics 4 (2009) 587-92. 

6. K.W. Tsai, W.C. Chan and W. C Lin, Sequence features involved in the mechanism of 3¢ splice junction wobbling. BMC Mol. Biol. 11 (2010) 34.

7. K.W. Tsai, L. Y. Hu, C. W. Wu, S. C. Li, C. H. Lai, H. W. Kao, W. L. Fang and W. C. Lin, Epigenetic Regulation of miR-196b Expression in Gastric Cancer. Genes, Chromosomes and Cancers.11 (2010) 969-80.  

8. S. C. Li, W. C. Chan, M. R. Ho, K.W. Tsai, L. Y. Hu, C. H. Lai, C. N. Hsu, P. P. Hwang, W. C. Lin, Discovery and characterization of medaka miRNA genes by next generation sequencing platform. BMC Genomic,11 (2010) suppl 4:S8   

9.  M.R. Ho, K.W. Tsai, C.H. Chen, W.C. Lin, dbDNV: a resource of duplicated-gene nucleotide variants in human genome, Nucleic Acids Research 39(2011) D920-5

10. S. C Li, W.C. Chan, C.H. Lai, K.W. Tsai, C.N. Hsu, Y.S. Jou, H.C. Chen, C.H. Chen and W.C. Lin, UMARS: Un-MAppable Reads Solution, BMC bioinformatics (2011) (in press)

11. K. W. Tsai, C. W. Wu, L. Y. Hu, S. C. Li, C. H. Lai, H. W. Kao, W. L. Fang and W. C. Lin, Epigenetic Regulation of miR-34 and miR-129 Expression in Gastric Cancer. International journal of cancer (2011) (in press)

研討會論文

1.   K.W. Tsai, , W.Y. Tarn , W.C. Lin. Wobble splicing reveals the role of the branch point    

      sequence-to-NAGNAG region in 3' tandem splice site selection. 7th Master Thesis Awards of   

      the  Graduate Institute of Life Sciences, National Defense Medical Center, Taipei, Taiwan,  

      2007

2.   K.W. Tsai, , W.Y. Tarn , W.C. Lin. Wobble splicing reveals the role of the branch point   sequence-to-NAGNAG region in 3' tandem splice site selection. Symposium on the Frontier Biomedical Sciences. Taipei, Taiwan, Aug 11-12, 2007.

3.   K.W. Tsai, , W.Y. Tarn , W.C. Lin. Wobble splicing reveals the role of the branch point sequence-to-NAGNAG region in 3' tandem splice site selection.The 22th Joint Annual conference of Biomedical Sciences. Taipei, Taiwan, 2007.

4.    K.W. Tsai, W.C. Lin. Wobble splicing regulation at tandem splice sites. 16 th Symposium on  

       Recent Advances in Cellular and Molecular Biology. Kenting, Taiwan, Jun 23-25, 2008.

5.    K.W. Tsai, W.C. Lin. Wobble splicing regulation at tandem splice sites. 99 th American   

       Association for Cancer Research Annual Meeting. Sen Deigo, CA, American, Apr 23-25, 2008.

6.   K. W. Tsai, Hsiao-Chun Tseng, Wen-Ching Chan and Wen-chang Lin. Wobble splicing: Subtle alternative splicing at tandem splice sites in human genome. 12th SCBA (Society of Chinese Bioscientistis in America) International Symposium Science for a Healthier and Better Life. Taipei, Taiwan. June 14-18, 2009.