美容醫學中心
心臟血管醫學中心
輻射安全室
腦中風中心
代謝減重中心
戒菸治療管理中心
研創暨智慧醫療中心
先天性/結構性心臟病醫學中心
整合醫學科
燒燙傷暨高壓氧治療中心
糖尿病中心
關節置換照護中心
罕病暨遺傳諮詢中心
優生保健科
高階角膜雷射中心
微生物科
牙周病科
牙體復形科
特殊需求者口腔醫療中心
醫事教學科
精準醫學暨細胞治療中心
病房主任管理中心
藥事照護中心
受試者保護中心
國際醫療事務中心 (113年5月成立)
遠距醫療照護中心 (113年6月成立)
睡眠中心 (114年成立)
顱底醫學中心 (114年成立)
高市聯醫醫療主權式 AI 大樓籌備處暨營運管理中心 (114年成立)
兒童暨青少年健康照護中心 (114年成立)
品質認證科 (114年成立)
法律研究中心 (暫停運作)